Генотипирањето и фенотипирањето можат да идентификуваат, и дури и да предвидуваат, ХИВ-отпорност на лекови
Дури и за луѓето со оптимално придржување кон терапијата, се очекува дека одреден степен на отпорност на лекови кон ХИВ ќе се развие со текот на времето, поради природни мутации на вирусот. Во други случаи, резистенцијата може брзо да се развие, кога неоптималната приврзаност дозволува да се развие отпорна популација на ХИВ, што на крајот ќе доведе до неуспех во третманот.
Кога се појави неуспех во третманот, мора да се изберат алтернативни комбинации на лекови за да се спречи оваа нова популација на резистентен вирус.
Тестирањето на генетскиот отпор помага да се олесни ова со идентификување на видовите на резистентните мутации во "вирусен пул" на лицето, додека се утврдува колку се подложни на овие вируси на можни антиретровирусни агенси .
Две основни алатки се користат за тестирање на генетски отпор кај ХИВ: генотипско тестирање на ХИВ и фенотип на ХИВ анализа .
Што е генотип и фенотип?
По дефиниција, генотип е едноставно генетска структура на организмот, додека фенотип е видливи карактеристики или карактеристики на тој организам.
Генотипични анализи (или генотипи) функција со идентификување на наследените инструкции во рамките на генетското кодирање на клетката, или ДНК. Фенотипските анализи (или фенотипи) го потврдуваат изразувањето на овие инструкции под влијание на различни еколошки услови.
Иако асоцијацијата помеѓу генотипот и фенотипот не е апсолутна, генотипот често може да биде предиктивен за фенотип, особено кога промените во генетскиот код се доделуваат на очекуваните промени во особините или карактеристиките - како во случајот со развојот на отпорност на лекови.
Фенотипот, од друга страна, го потврдува "тука-и-сега". Таа има за цел да ја процени реакцијата на организмот на специфични промени во притисокот на животната средина - како што е кога ХИВ е изложен на различни лекови и / или концентрации на лекови.
Објаснување на генотипирањето на ХИВ
Генотипот на ХИВ генерално е најчестата технологија што се користи за тестирање на отпор.
Целта на анализата е да се откријат специфични генетски мутации во регионот на gag-pol на геномот на вирусот (или генетскиот код). Ова е регионот каде што ензимите на реверзна транскриптаза, протеаза и интеграза - целите на повеќето антиретровирусни лекови - се кодирани на ДНК синџирот.
Со прво засилување на геномот на ХИВ користејќи технологија на полимеразна верижна реакција (ПЦР) , лабораториските техничари можат да секвенца (или "карта") генетиката на вирусот користејќи разни технологии за откривање на мутации.
Мутации на тезите (или акумулација на мутации) се толкуваат од техничари кои ја анализираат односот помеѓу идентификуваните мутации и очекуваната подложност на различни антиретровирусни лекови. Онлајн бази на податоци може да им помогне со споредување на тест-секвенцата со онаа на прототипот "див тип" вирус (т.е. ХИВ кој не содржи отпорни мутации).
Интерпретацијата на овие тестови се користи за да се утврди чувствителноста на лековите, при што поголем број на клучни мутации даваат повисоки нивоа на отпорност на лекот .
Објаснување на Фенитопирање на ХИВ
ХИВ-фенотипот го проценува растот на ХИВ на лицето во присуство на лек, а потоа го споредува со растот на контролниот див тип на вирус во ист лек.
Како и со генотипските анализи, фенотипските тестови го зголемуваат гег-полето на геномот на ХИВ.
Овој дел од генетскиот код потоа се "пресади" врз див тип на клон со употреба на рекомбинантна ДНК технологија . Резултирачкиот рекомбинантен вирус се користи за инфицирање на клетки на цицачи in vitro (во лабораторија).
Виралниот примерок потоа е изложен на зголемување на концентрациите на различни антиретровирусни лекови се додека не се постигне 50% и 90% вирусна супресија. Концентрациите потоа се споредуваат со резултатите од контролата, примерок од див тип.
Релативните "преклопни" промени обезбедуваат опсег на вредности со кои се одредува чувствителноста на лековите. А четирикратна промена едноставно значи дека четири пати повеќе од износот на дрога е потребно за да се постигне вирусна супресија во споредба со онаа на дивиот тип.
Колку е поголема вредноста на зглобот, толку помалку е подложно на вирусот на специфичен лек.
Овие вредности потоа се ставаат во ниско-клиничките и горните клинички опсези, при што горните вредности даваат повисоки нивоа на отпорност на лекот. (Видете извештај за примерок .)
Кога се спроведува тест за генетичка отпорност?
Во САД, тестирањето на генетски отпор традиционално се изведува кај пациенти кои не се на терапија, за да утврдат дали имаат "стекната" резистенција на лекот. Студиите во САД сугерираат дека помеѓу 6% и 16% од пренесениот вирус ќе биде отпорен на најмалку еден антиретровирусен лек, додека скоро 5% ќе бидат отпорни на повеќе од една класа на лекови.
Тестирањето на генетскиот отпор се користи и кога постои сомневање за отпорност на лекот кај индивидуи на терапија. Тестирањето се изведува додека пациентот го зема неуспешниот режим или во рок од четири недели од прекинувањето на третманот ако вирусното оптоварување е поголемо од 500 копии / мл. Генотипичното тестирање е генерално најпосакувано во овие случаи, бидејќи тие чинат помалку, имаат побрзо време на реализација и нудат поголема чувствителност за откривање на мешавина на див тип и отпорен вирус.
Комбинација на фенотипско и генотипско тестирање е генерално најпосакувана за лица со сложена, отпорност на повеќе лекови, особено за оние кои се изложени на протеазни инхибитори .
Извори:
Светска здравствена организација (СЗО). "Информативен лист за отпорност на лекови против ХИВ". Женева, Швајцарија; 11 април 2011 година.
Ким, Д .; Зибел, Р .; Садувала, Н .; et al. "Тренд во пренесувањето на мутации поврзани со ХИВ-1 АРВ отпорност на лекови: 10 области за надзор на ХИВ, САД, 2007-2010". 20-тата конференција за ретровирусите и опортунистичките инфекции. Атланта, Џорџија; 6 март 2013 година; Орален апстракт 149.
Национални институти за здравство (НИХ). "Насоки за употреба на антиретровирусни агенси кај ХИВ-1-заразени возрасни и адолесценти". Бетесда, Мериленд; 11 октомври 2013 година.